Вручную менять ничего не нужно. В админке напротив тех разделов, где наблюдается подобная проблема, нужно просто пересчитать статистику, кликнув ссылку Пересчитать. Если раздел имеет подфорумы, то сначала нужно пересчитать статистику подфорумов, и только потом статистику этого раздела. После того, как данная проблема будет устранена во всех разделах, где она наблюдалась, можно пересчитать глобальную статистику по всему форуму, кликнув ссылку Обновить статистику конференции (она находится в админке над списком разделов). В этом случае будет также обновлена статистическая информация, которая отображается на главной странице форума в блоке Статистика конференции

неа, количество сообщений в каждой теме можно пересчитать только внутри темы, а потом количество тем через админку. Я эти кнопочки все понаходил)
но я уже все сделал, все работает, спама, слава Богу нет.