function convertFile($file) {
$content = file_get_contents($file);
$data = unserialize($content);
$utf8_data = convert($data); // Массив с данными, но уже в UTF-8
file_put_contents($file, serialize($utf8_data));
}

function convert($data) {
foreach ($data as $name => $var) {
if (is_string($var)) $data[$name] = iconv('Windows-1251', 'UTF-8', $var);
elseif (is_array($var)) {
$data[$name] = convert($var);
}
}

return $data;
}

convertFile('file.data');